În afara activităţii de rutină, centrul este implicat şi într-o serie de activităţi de cercetare ştiinţifică. MEDINST a participat de-a lungul activităţii sale la diferite studii şi programe: studiu de cercetare privind patologia cerebrovasculară şi stroke împreună cu Institutul Naţional de Neurologie şi Boli Neurovasculare, program de cercetare referitor la scleroza multiplă în plăci (Betafer-01-Ro) în colaborare cu Institutul Naţional de Neurologie şi Boli Neurovasculare şi cu compania farmaceutică Schering, studiu asupra bolnavilor HIV, desfăşurat în colaborare cu Spitalul de Boli Infecţioase Dr. Victor Babeş, studiu de cercetare privind afecţiunile cerebrale la copii cu retard, studii de cercetare asupra bolii Alzheimer în colaborare cu Astrazeneca UK și cu Servier, studiu de cercetare asupra maladiei Parkinson – în colaborare cu Sp. Burghele, studiu asupra epilepsiei – coordonat de dr. Maria Ladea, Sp. Clinic de Psihiatrie Prof. dr. Al. Obregia.
