Câmpul magnetic nu prezintă pericol. În cazul unor investigaţii poate fi necesară administrarea intravenoasă a unei substanţe de contrast. Substanţele de contrast sunt în general bine tolerate; în caz de sensibilizare (alergie), pot apărea însă unele reacţii ca: prurit, urticarie, greţuri, care se remit de la sine.
Singurele riscuri sunt cele pentru pacienţii cu stimulator cardiac sau care deţin corpuri straine, metalice, implantate și neanunţate medicului. La intrarea în sala RM va trebui să nu existe asupra pacientului obiecte ca: ceasuri, cărţi de credit sau cecuri, portofele, chei, pixuri şi stilouri, anumite bijuterii, alte obiecte metalice (verificarea se face de către asistentul-operator).
